Несторий утверждает о неслиянном сосуществовании во Христе двух природ. Обе природы представлены в полноте (в полемике против Аполлинария, этот тезис утвердили еще "великие каподокийцы"), но существуют по раздельности. Несторий возражает против именования матери Христа "Богородицей", так как она, по учению Нестория, родила только "человеческую природу"Спасителя, являясь лишь "Христородицей". Это учение было подвержено критике святителем Кириллом Александрийским и было осуждено на Третьем Вселенском Соборе 431-433 года.